Алексей Губарев родился 29 марта 1931 года в селе Гвардейцы Борского района Куйбышевской области в семье крестьянина. С 1936 года жил и учился в подмосковном совхозе «Чашниково», куда перебралась семья после смерти отца. В декабре 1941 года отступающие гитлеровские войска сожгли дом Губаревых. Семья вынуждена была перебраться сначала в подмосковные Химки, а потом вернуться в родное село. После окончания войны Губаревы перебрались в подмосковное Крюково.
В 1950 году Алексей окончил среднюю школу и поступил в Морское авиационное училище техников. Узнав, что в училище готовят обслуживающий персонал, уже в ноябре 1950 года он при первой возможности добился перевода в Военно-морское минно-торпедное авиационное училище. После его окончания в 1952 году Губарев служил в частях ВВС СССР. С декабря 1952 года он – лётчик, с марта 1953 года – старший лётчик 1540-го минно-торпедного авиаполка (с 1955 – 928-й авиаполк) 598-й минно-торпедной авиадивизии (с 1955 – 130-я авиадивизия), с января 1956 года – командир звена 5-го минно-торпедного авиаполка той же авиадивизии ВВС ТОФ. С февраля 1956 года Губарев – командир звена 926-го гвардейского минно-торпедного авиаполка 13-й минно-торпедной авиадивизии ВВС. С сентября 1961 года он – командир эскадрильи 855-го отдельного минно-торпедного авиаполка ВВС ЧФ. Летал на самолётах Як-18, Ту-2, Ил-28м, Л-29, налёт – более 1450 часов. В 1957 году Алексей Губарев поступил и в 1961 году окончил Военно-воздушную академию.
В январе 1963 года он был зачислен в отряд советских космонавтов (Группа ВВС № 2). Губарев прошёл полный курс общекосмической подготовки. Проходил подготовку по советской лунной программе, в составе группы осваивал военно-исследовательский вариант космического корабля «Союз» (корабль 7К-ВИ). В дальнейшем он готовился к космическим полётам на кораблях типа «Союз» (по программе «Контакт») и орбитальных станциях типа «Салют» (ДОС) в качестве командира, неоднократно был дублёром.
В сентябре 1973 года Губарев был назначен командиром дублирующего экипажа (вместе с Георгием Михайловичем Гречко) для полёта на космическом корабле «Союз-12». Свой первый полёт он совершил с 11 января по 9 февраля 1975 года вместе с Гречко в качестве командира космического корабля «Союз-17» и орбитального комплекса «Салют-4» – «Союз-17» (позывной – «Зенит»). Продолжительность пребывания его в космосе составила 29 дней 13 часов 19 минут 45 секунд (рис. 2).
С 1976 года Губарев проходил подготовку по программе сотрудничества с социалистическими странами «Интеркосмос». Свой второй полёт он совершил со 2 по 10 марта 1978 года вместе с чехом Владимиром Ремеком в качестве командира космического корабля «Союз-28» (позывной – «Зенит»). Это был первый пилотируемый полёт по программе «Интеркосмос». Космонавты работали на борту орбитального комплекса «Салют-6» – «Союз-27 – «Союз-28» вместе с Юрием Викторовичем Романенко и Георгием Михайловичем Гречко. Продолжительность их пребывания в космосе составила 7 дней 22 часа 16 минут. Всего за два полёта в космос Губарев налетал 37 дней 11 часов 35 минут 45 секунд (рис. 3-7).
В 1981 году он покинул отряд космонавтов, но продолжал службу на командных должностях в Центре подготовки космонавтов имени Ю.А. Гагарина. В 1980-х годах он был заместителем начальника 30-го Центрального научно-исследовательского института Министерства обороны. С 1988 года А.А. Губарев находился в отставке.
Алексей Александрович Губарев скончался 21 февраля 2020 года. Прощание и похороны прошли 25 февраля на Федеральном военно-мемориальном кладбище.
Именем Алексея Губарева названа малая планета № 2544.
Автор книг:
Губарев А.А. Притяжение невесомости. Документальная повесть / [Лит. запись Б. А. Бобылева] М.: Современник, 1982.
Губарев А.А. Орбита жизни / М.: Мол. гвардия, 1990.
Губарев А.А. Космос начинается на земле. Эпизоды… / М.: Русский раритет, 2011.
Губарев А.А., Ремек В. Породнённые орбитой / М.: Мол. гвардия, 1983.